Státní zemědělská a potravinářská inspekce provádí kontroly u výrobců potravin, v obchodní síti a ve spolupráci s Celní správou ČR zároveň také kontroluje dovoz potravin ze třetích zemí, to jest ze zemí, které nejsou členy Evropské unie. Díky těmto kontrolám se daří zadržet dodávky závadného zboží ještě před jeho dalším zpracováním či prodejem konečnému spotřebiteli.

Státní zemědělská a potravinářská inspekce a Celní správa ČR spolupracují při úřední kontrole dovozu potravin rostlinného původu řadu let, první vzájemná dohoda byla podepsána již v roce 1998.

Státní zemědělské a potravinářské inspekci ve spolupráci s Celní správou ČR se podařil další úspěšný zásah.

Hlavní prioritou všech dozorových orgánů kontrolujících potraviny je bezpečnost. Do této oblasti spadá i kontrola označování alergenních složek potravin. Právní předpisy přesně definují, které složky potravin nebo látky z nich pocházející jsou považovány za alergeny. Mezi ty nejznámější patří arašídy, vejce, mléko, lepek, korýši nebo sója.

Státní zemědělská a potravinářská inspekce ve spolupráci s celním úřadem v Praze zadržela dodávku mandlí původem z USA. Důvodem je pětinásobné překročení limitu na obsah aflatoxinů. Dodávka o celkové hmotnosti 9,5 tuny obsahovala 420 kartonů přírodních mandlí bez skořápky.

Státní zemědělská a potravinářská inspekce obdržela prostřednictvím Systému včasného varování pro potraviny a krmiva v EU informace o tom, že byla na naše území distribuována další potravina, v níž byl prokázán nadlimitní obsah melaminu.

Státní zemědělské a potravinářské inspekci se podařil další úspěšný zásah proti nebezpečným potravinám. Uplynul více než měsíc od doby, kdy byl odhalen doplněk stravy s nepovolenou látkou tadalafil, a už musela inspekce řešit hned další tři podobné případy.

Státní zemědělská a potravinářská inspekce je jednou ze složek radiační monitorovací sítě v ČR, kterou řídí Státní úřad pro jadernou bezpečnost a která sleduje výskyt radiace jak v životním prostředí, tak v celém potravinovém řetězci.

Největší množství kontrol provádí Státní zemědělská a potravinářská inspekce přímo v obchodech, v případě potravin rostlinného původu však také kontroluje výrobu, přepravu i dovoz ze třetích zemí.